慢性骨髓炎由于病程长，导致全身正气虚弱，气血生化无力，抵抗力低下，另外由于慢性骨髓炎往往有死腔、骨包壳、明显的死骨、周围组织纤维瘢痕等病理改变，局部血液循环进一步减弱，使得抗菌药物难以通过血循环而到达病灶，使得机体免疫系统和其他抗病因素在局部不能发挥有效作用。因而慢性骨髓炎的治疗是比较困难的。